民國七十八年元月三十日，教育部為均衡城鄉教育之發展，解決南部藝術學府缺乏困境，奉行政院同意於臺南縣新設 藝術學院。同年六月成立籌備小組，負責各項籌建事宜，建校用地則由臺南縣政府無償提供官田鄉社子段之土地約五 十七點五八公頃。

民國八十二年七月十五日，本校籌備處成立。

民國八十四年元月，本校基地環境影響評估通過，二月四日行政院通過本校建校計畫，五月二十七日開始整地，八月三十一日第一期校舍工程動工。

八國八十五年三月十三日，行政院通過本校設置系所計畫，核准於八十五年七月一日正式設校，並任命漢寳德先生為首任校長，第一年開設音像紀錄、博物館學、造型藝術及藝術史與藝術評論四個研究所。同年的十月一日，本校第一屆研究所新生於臺南校園註冊上課。

民國八十六年九月另加設應用藝術及建築藝術兩個研究所，以及七年一貫制音樂科系。